RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD45Q5TZF3 282 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 KLRG1Q96E93 195 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 USP40Q9NVE5 1235 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.31□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHDP01880 384 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 NF2P35240 595 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TNNI2P48788 182 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 AAMPQ13685 434 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 MOB2Q70IA6 237 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 SLF2Q8IX21 1173 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 FZD1Q9UP38 647 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.3□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 GOLIM4O00461 696 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 VEGFBP49765 207 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 HUNKP57058 714 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 GSTO1P78417 241 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TCP10Q12799 353 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TNFAIP1Q13829 316 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF384Q8TF68 577 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTNAP1P78357 1384 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 RASSF10A6NK89 507 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5JP18859 108 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 BTDP43251 543 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFPM1Q8IX07 1006 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 GCC1Q96CN9 775 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPNS2Q96L46 248 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 AOC2O75106 756 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP7A1P22680 504 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 ECE1P42892 770 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS3P49796 1198 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 MAP3K12Q12852 859 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 NFIAQ12857 509 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 PICALMQ13492 652 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 TSHZ3Q63HK5 1081 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 RGMBQ6NW40 437 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM83AQ86UY5 434 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM151AQ8WW52 585 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 TEPSINQ96N21 525 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 HAUS7Q99871 368 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 GAKO14976 1311 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 DOCK2Q92608 1830 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 BAG3O95817 575 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 FKBP1BP68106 108 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX11Q8IYF3 940 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-211ENST00000588374 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms