RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 ERO1BQ86YB8 467 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa24.14■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.13■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 CETPP11597 493 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 PRDX5P30044 214 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 DIXDC1Q155Q3 683 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 ARMC5Q96C12 935 aa24.12■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 POTEFA5A3E0 1075 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 IRF6O14896 467 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 PPIL2Q13356 520 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 FAM151AQ8WW52 585 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 SNAPC2Q13487 334 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.1■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 SEMA3EO15041 775 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
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TRAF4-216ENST00000586813 TCP10Q12799 353 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 MEIS3Q99687 375 aa24.09■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
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TRAF4-216ENST00000586813 INPP5BP32019 993 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 NFIAQ12857 509 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGEF6Q15052 776 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 COPRSQ9NQ92 184 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.08■■□□□ 1.45
TRAF4-216ENST00000586813 TLR2O60603 784 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 PPATQ06203 517 aa24.07■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ADORA1P30542 326 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF112Q9UJU3 913 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.06■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ZBTB22O15209 634 aa24.05■■□□□ 1.44
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TRAF4-216ENST00000586813 CCDC102BQ68D86 513 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF333Q96JL9 665 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 USP40Q9NVE5 1235 aa24.05■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.03■■□□□ 1.44
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TRAF4-216ENST00000586813 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.03■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 DOCK1Q14185 1865 aa24.02■■□□□ 1.44
TRAF4-216ENST00000586813 RASGRF1Q13972 1273 aa24.02■■□□□ 1.44
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TRAF4-216ENST00000586813 CCER2I3L3R5 266 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 SRGAP3O43295 1099 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 GNAI3P08754 354 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 KIF22Q14807 665 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 NBPF11Q86T75 865 aa24.01■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
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TRAF4-216ENST00000586813 RGS3P49796 1198 aa24■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 TIMM10P62072 90 aa24■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 MTX1Q13505 466 aa24■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 IDI2Q9BXS1 227 aa24■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24■■□□□ 1.43
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TRAF4-216ENST00000586813 C17orf99Q6UX52 265 aa23.99■■□□□ 1.43
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TRAF4-216ENST00000586813 MOGSQ13724 837 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 XAGE2Q96GT9 111 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 CPA4Q9UI42 421 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.98■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 SLF2Q8IX21 1173 aa23.97■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 PRMT2P55345 433 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
TRAF4-216ENST00000586813 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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