RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-211	ENST00000574157	PTH1R	Q03431	593 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	AOC3	Q16853	763 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DACT2	Q5SW24	774 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	KIF2C	Q99661	725 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PCNT	O95613	3336 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GNAT2	P19087	354 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GTF2I	P78347	998 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ALX1	Q15699	326 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CERS5	Q8N5B7	392 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		10.75	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	YDJC	A8MPS7	323 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MBD4	O95243	580 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	LDHC	P07864	332 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PPP4C	P60510	307 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RABEP1	Q15276	862 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MRI	Q9BWK5	157 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.74	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	LAMB1	P07942	1786 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157		G3V3G9	751 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GRIK5	Q16478	980 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	VPS53	Q5VIR6	699 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	NIM1K	Q8IY84	436 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	LCORL	Q8N3X6	602 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CREBZF	Q9NS37	354 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PALD1	Q9ULE6	856 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		10.73	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC27A2	O14975	620 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PLCG2	P16885	1265 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MMP14	P50281	582 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GML	Q99445	158 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ARMT1	Q9H993	441 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	JAG2	Q9Y219	1238 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.72	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	FOXN1	O15353	648 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	POTEJ	P0CG39	1038 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	KRT32	Q14532	448 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	SNX21	Q969T3	373 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.71	□□□□□ -0.69
NOMO3-211	ENST00000574157	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.7	□□□□□ -0.7
NOMO3-211	ENST00000574157	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
NOMO3-211	ENST00000574157	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		10.7	□□□□□ -0.7
NOMO3-211	ENST00000574157	BAG3	O95817	575 aa		10.7	□□□□□ -0.7
NOMO3-211	ENST00000574157	CYP21A2	P08686	494 aa		10.7	□□□□□ -0.7
NOMO3-211	ENST00000574157	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.7	□□□□□ -0.7

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