RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 XAGE2Q96GT9 111 aa25.93■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 TCP10Q12799 353 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.743e-7■■□□□ 12.7
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF15Q66K64 600 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 OTUD5Q96G74 571 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 WRNIP1Q96S55 665 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 USP40Q9NVE5 1235 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 ABCF2Q9UG63 623 aa25.92■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 RGS19P49795 217 aa25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 RASGRF1Q13972 1273 aa25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 FAM151AQ8WW52 585 aa25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 GORABQ5T7V8 394 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 PTPN18Q99952 460 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.89■■□□□ 1.74
PPP4C-211ENST00000567642 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 GTF2A2P52657 109 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SOX10P56693 466 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 NFIAQ12857 509 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 CRHR2Q13324 411 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 CCL15Q16663 113 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.88■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 DOCK2Q92608 1830 aa25.87■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB22O15209 634 aa25.87■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ERO1BQ86YB8 467 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 SLF2Q8IX21 1173 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.86■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 TRIM17Q9Y577 477 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.85■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 INPP5BP32019 993 aa25.84■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ATP8B2P98198 1209 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 ERO1AQ96HE7 468 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 HMG20BQ9P0W2 317 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 GAKO14976 1311 aa25.83■■□□□ 1.73
PPP4C-211ENST00000567642 RLBP1P12271 317 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 RGS3P49796 1198 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 POLA2Q14181 598 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 PI16Q6UXB8 463 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 SPATA5Q8NB90 893 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.82■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 IRF6O14896 467 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 CETPP11597 493 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 BTDP43251 543 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 SP3Q02447 781 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 MECOMQ03112 1051 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 PPIL2Q13356 520 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 SNAPC2Q13487 334 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.81■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 SSH3Q8TE77 659 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 IDI2Q9BXS1 227 aa25.8■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ENTPD3O75355 529 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 PPATQ06203 517 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 PICALMQ13492 652 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 RAI14Q9P0K7 980 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.79■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 BTBD19C9JJ37 291 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 LDHCP07864 332 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 MCAMP43121 646 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 GSTO1P78417 241 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 TNNI3KQ59H18 835 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.77■■□□□ 1.72
PPP4C-211ENST00000567642 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms