RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567092.1

CFAP20-206, Transcript of cilia and flagella associated protein 20, human

TSL 2

Gene CFAP20, Length 710 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CFAP20-206	ENST00000567092	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	GTF2I	P78347	998 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	NOG	Q13253	232 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	TMC2	Q8TDI7	906 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	SLC34A2	O95436	690 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	FKBP1B	P68106	108 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	ABHD8	Q96I13	439 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	CA12	O43570	354 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	MMP14	P50281	582 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	GRIK5	Q16478	980 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CFAP20-206	ENST00000567092	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PPP1R37	O75864	691 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	GYG1	P46976	350 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	KCNJ4	P48050	445 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	FGFR2	P21802	821 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PDE4A	P27815	886 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	CENPF	P49454	3210 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	PDE8B	O95263	885 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	RGS3	P49796	1198 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	DLGAP5	Q15398	846 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	BRCA2	P51587	3418 aa		13.83	□□□□□ -0.19
CFAP20-206	ENST00000567092	TRPA1	O75762	1119 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	GJA5	P36382	358 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	EYA2	O00167	538 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CFAP20-206	ENST00000567092	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2

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