RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563877.5

FAM219B-208, Transcript of family with sequence similarity 219 member B, human

TSL 2

Gene FAM219B, Length 742 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM219B-208	ENST00000563877	LAMB1	P07942	1786 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM219B-208	ENST00000563877	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
FAM219B-208	ENST00000563877	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM219B-208	ENST00000563877	CSAD	Q9Y600	493 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM219B-208	ENST00000563877	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		29.08	■■■□□ 2.25
FAM219B-208	ENST00000563877	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM151A	Q8WW52	585 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		29.07	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	FKTN	O75072	461 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	USP40	Q9NVE5	1235 aa		29.06	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	TCP10	Q12799	353 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	WRNIP1	Q96S55	665 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	PTPN18	Q99952	460 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	ABCF2	Q9UG63	623 aa		29.05	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	RGS19	P49795	217 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	NFIA	Q12857	509 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	DCAF15	Q66K64	600 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		29.04	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	GORAB	Q5T7V8	394 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	OTUD5	Q96G74	571 aa		29.03	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	RLBP1	P12271	317 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	POLA2	Q14181	598 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		29.02	■■■□□ 2.24
FAM219B-208	ENST00000563877	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	GTF2A2	P52657	109 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ATP8B2	P98198	1209 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		29.01	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	GAK	O14976	1311 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	CRHR2	Q13324	411 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	SLF2	Q8IX21	1173 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	SSH3	Q8TE77	659 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		29	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	CCL15	Q16663	113 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ERO1B	Q86YB8	467 aa		28.99	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.98	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	MECOM	Q03112	1051 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.97	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	INPP5B	P32019	993 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	RGS3	P49796	1198 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.96	■■■□□ 2.23
FAM219B-208	ENST00000563877	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		28.95	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	IRF6	O14896	467 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	ENTPD3	O75355	529 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	BTD	P43251	543 aa		28.94	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	CETP	P11597	493 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	MCAM	P43121	646 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	SOX10	P56693	466 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	PPIL2	Q13356	520 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	SNAPC2	Q13487	334 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	ZNF384	Q8TF68	577 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.93	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	PPAT	Q06203	517 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	PANK1	Q8TE04	598 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	ERO1A	Q96HE7	468 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	TRIM17	Q9Y577	477 aa		28.92	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	GSTO1	P78417	241 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	SP3	Q02447	781 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	RAI14	Q9P0K7	980 aa		28.91	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.9	■■■□□ 2.22
FAM219B-208	ENST00000563877	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		28.9	■■■□□ 2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms