RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM83AQ86UY5 434 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCL11AQ9H165 835 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAI14Q9P0K7 980 aa15.17■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FOXN1O15353 648 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 LDHCP07864 332 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 IREB2P48200 963 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 LDLRAD1Q5T700 205 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASAL3Q86YV0 1011 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEPSINQ96N21 525 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 FZD1Q9UP38 647 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 GAKO14976 1311 aa15.16■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K11Q16584 847 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOOK2Q96ED9 719 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZIC5Q96T25 663 aa15.15■□□□□ 0.02
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARAP2Q8WZ64 1704 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 UNCXA6NJT0 531 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 BTDP43251 543 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZAP70P43403 619 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TCP10Q12799 353 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM151AQ8WW52 585 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.14■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CA12O43570 354 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 IGSF3O75054 1194 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NFIAQ12857 509 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRCC1Q9C099 1032 aa15.13■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCAF15Q66K64 600 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF384Q8TF68 577 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CSRNP1Q96S65 589 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRBNQ96SW2 442 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 IDI2Q9BXS1 227 aa15.12■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ENTPD3O75355 529 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 LBX1P52954 281 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K9P80192 1104 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCTPP1Q9H773 170 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.11■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 IDH1O75874 414 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 BAG3O95817 575 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 RGS3P49796 1198 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 SPRYD7Q5W111 196 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MIGA2Q7L4E1 593 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 CSADQ9Y600 493 aa15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLCG2P16885 1265 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 RHBDL3P58872 404 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K12Q12852 859 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PICALMQ13492 652 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 WNK4Q96J92 1243 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 TSKSQ9UJT2 592 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYH13Q9UKX3 1938 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 PCNTO95613 3336 aa15.09■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 ECM29Q5VYK3 1845 aa15.08■□□□□ 0.01
USP3-AS1-205ENST00000560067 THSD7BQ9C0I4 1608 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP7A1P22680 504 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 SREBF2Q12772 1141 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEX11Q8IYF3 940 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 WRNIP1Q96S55 665 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 ELP3Q9H9T3 547 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 RNF186Q9NXI6 227 aa15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.08■□□□□ 0
USP3-AS1-205ENST00000560067 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms