RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558754.5

MIR9-3HG-205, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 786 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DOCK2Q92608 1830 aa29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ALDH1A1P00352 501 aa29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TCP10Q12799 353 aa29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.6■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 INHBEP58166 350 aa29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MAP3K9P80192 1104 aa29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WRNIP1Q96S55 665 aa29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCF2Q9UG63 623 aa29.59■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GORABQ5T7V8 394 aa29.58■■■□□ 2.33
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NFIAQ12857 509 aa29.57■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 OTUD5Q96G74 571 aa29.57■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.57■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FKTNO75072 461 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RLBP1P12271 317 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HOOK2Q96ED9 719 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 USP40Q9NVE5 1235 aa29.56■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DCAF15Q66K64 600 aa29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.55■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.54■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FAM151AQ8WW52 585 aa29.54■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PI16Q6UXB8 463 aa29.53■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.53■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CRHR2Q13324 411 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CCL15Q16663 113 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PTPN18Q99952 460 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.52■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GAKO14976 1311 aa29.51■■■□□ 2.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 POLA2Q14181 598 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.51■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZBTB22O15209 634 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GTF2A2P52657 109 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SOX10P56693 466 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SPATA5Q8NB90 893 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.5■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGS3P49796 1198 aa29.49■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SLF2Q8IX21 1173 aa29.49■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SSH3Q8TE77 659 aa29.49■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.48■■■□□ 2.31
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MIR9-3HG-205ENST00000558754 INPP5BP32019 993 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BTDP43251 543 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATP8B2P98198 1209 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MECOMQ03112 1051 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERO1BQ86YB8 467 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PANK1Q8TE04 598 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.48■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MCAMP43121 646 aa29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PICALMQ13492 652 aa29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TNNI3KQ59H18 835 aa29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.46■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DBNDD2Q9BQY9 259 aa29.45■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RAI14Q9P0K7 980 aa29.45■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRIM17Q9Y577 477 aa29.45■■■□□ 2.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 IRF6O14896 467 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PPIL2Q13356 520 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TTC39AQ5SRH9 613 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 IDI2Q9BXS1 227 aa29.44■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ENTPD3O75355 529 aa29.43■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CETPP11597 493 aa29.43■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZNF384Q8TF68 577 aa29.43■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SNRKQ9NRH2 765 aa29.43■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DOCK1Q14185 1865 aa29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RGS19P49795 217 aa29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SNAPC2Q13487 334 aa29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERO1AQ96HE7 468 aa29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.41■■■□□ 2.3
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