RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 CEP85Q6P2H3 762 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 SLF2Q8IX21 1173 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 SPATA5Q8NB90 893 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 HOOK2Q96ED9 719 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 ELP3Q9H9T3 547 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 GPR108Q9NPR9 543 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 USP40Q9NVE5 1235 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.66■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 TCP10Q12799 353 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 PI16Q6UXB8 463 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D8O95759 1140 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MAP3K9P80192 1104 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 FAM151AQ8WW52 585 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 ABHD8Q96I13 439 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 COG6Q9Y2V7 657 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 CSADQ9Y600 493 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 GAKO14976 1311 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MCAMP43121 646 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 NFIAQ12857 509 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 DGKZQ13574 1117 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 DCAF15Q66K64 600 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 OPTNQ96CV9 577 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 GJA5P36382 358 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 INHBEP58166 350 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 VGLL4Q14135 290 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 WRNIP1Q96S55 665 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 BTDP43251 543 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MECOMQ03112 1051 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 RAI14Q9P0K7 980 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.61■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 ALDH1A1P00352 501 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 GSTO1P78417 241 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 IFNL1Q8IU54 200 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 SNRKQ9NRH2 765 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 AK9Q5TCS8 1911 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 LAMB1P07942 1786 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 LDHCP07864 332 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 RGS3P49796 1198 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 OTUD5Q96G74 571 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD1-209ENST00000557092 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 PICALMQ13492 652 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 IDI2Q9BXS1 227 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 GPR25O00155 361 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 HMMRO75330 724 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ENTPD3O75355 529 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF384Q8TF68 577 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 DOCK2Q92608 1830 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 AACSQ86V21 672 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 ERO1BQ86YB8 467 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 INPP5BP32019 993 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 GTF2A2P52657 109 aa22.54■■□□□ 1.2
NEDD1-209ENST00000557092 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.54■■□□□ 1.2
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