RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556975.5

TMEM260-214, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM260, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-214ENST00000556975 GPR108Q9NPR9 543 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 TBC1D8O95759 1140 aa27.98■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 ALDH1A1P00352 501 aa27.98■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 FAM151AQ8WW52 585 aa27.98■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 GJA5P36382 358 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 OTOFQ9HC10 1997 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 IFNL1Q8IU54 200 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 ABCF2Q9UG63 623 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 GAKO14976 1311 aa27.95■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 MS4A1P11836 297 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 GORABQ5T7V8 394 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 SLF2Q8IX21 1173 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ELP3Q9H9T3 547 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 USP40Q9NVE5 1235 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 HMG20BQ9P0W2 317 aa27.95■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 VGLL4Q14135 290 aa27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 OPTNQ96CV9 577 aa27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 CSADQ9Y600 493 aa27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.94■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 GPR25O00155 361 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 NFIAQ12857 509 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 DCAF15Q66K64 600 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 SPATA5Q8NB90 893 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 PANK1Q8TE04 598 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 TNNI3KQ59H18 835 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 IDI2Q9BXS1 227 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 FAM198AQ9UFP1 575 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa27.91■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 MS4A4AQ96JQ5 239 aa27.91■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 TCP10Q12799 353 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 CEP85Q6P2H3 762 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 WRNIP1Q96S55 665 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa27.9■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 SPDYE5A6NIY4 337 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 MCAMP43121 646 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 MECOMQ03112 1051 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 PTPN18Q99952 460 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa27.89■■■□□ 2.06
TMEM260-214ENST00000556975 ENTPD3O75355 529 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 RGS19P49795 217 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 PI16Q6UXB8 463 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF384Q8TF68 577 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa27.88■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 GTF2A2P52657 109 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 MIGA2Q7L4E1 593 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ERO1BQ86YB8 467 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.87■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 FKTNO75072 461 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 LDHCP07864 332 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ZFPM1Q8IX07 1006 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.86■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 AK9Q5TCS8 1911 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 BTDP43251 543 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 RGS3P49796 1198 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 GSTO1P78417 241 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 OTUD5Q96G74 571 aa27.85■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.84■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 BRI3BPQ8WY22 251 aa27.84■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 INPP5BP32019 993 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 RHBDL3P58872 404 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM260-214ENST00000556975 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 IGSF3O75054 1194 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 MAP3K10Q02779 954 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 PPATQ06203 517 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 PPIL2Q13356 520 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 CCL15Q16663 113 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM260-214ENST00000556975 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms