RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PTPRC	P08575	1304 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	TLR2	O60603	784 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	NFIA	Q12857	509 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	MOGS	Q13724	837 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	EYA2	O00167	538 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	CETP	P11597	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PPIL2	Q13356	520 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	C17orf99	Q6UX52	265 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PRDX5	P30044	214 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PPAT	Q06203	517 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	TCP10	Q12799	353 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	LPIN2	Q92539	896 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	GCC1	Q96CN9	775 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	MAST3	O60307	1309 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	MTFR1	Q15390	333 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	NBPF11	Q86T75	865 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	TRIM47	Q96LD4	638 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920		E9PSI1	815 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PDHX	O00330	501 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SLC5A1	P13866	664 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PHKA1	P46020	1223 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SHISA4	Q96DD7	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	SIL1	Q9H173	461 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
RBM23-211	ENST00000553920	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.15	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CIAO1	O76071	339 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	OSBP	P22059	807 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ADORA1	P30542	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PSMC4	P43686	418 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SRRD	Q9UH36	339 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	MGAM	O43451	1857 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GNRH1	P01148	92 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CYP2C8	P10632	490 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	BCR	P11274	1271 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	KIF22	Q14807	665 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
RBM23-211	ENST00000553920	GAK	O14976	1311 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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