RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550027.5

COPZ1-208, Transcript of coatomer protein complex subunit zeta 1, human

TSL 1 (best)

Gene COPZ1, Length 553 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPZ1-208	ENST00000550027	CHL1	O00533	1208 aa		11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	CXCL11	O14625	94 aa		11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	RIPK4	P57078	832 aa		11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.69	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.68	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	KLRK1	P26718	216 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	CHRND	Q07001	517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.67	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	PIEZO1	Q92508	2521 aa		11.66	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	ITGA6	P23229	1130 aa		11.66	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	CRK	P46108	304 aa		11.66	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	AOX1	Q06278	1338 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	CYP2C8	P10632	490 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	COL6A1	P12109	1028 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.65	□□□□□ -0.54
COPZ1-208	ENST00000550027	NCOR1	O75376	2440 aa		11.65	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	PFAS	O15067	1338 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MAST3	O60307	1309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MOGS	Q13724	837 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		11.64	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	CDH23	Q9H251	3354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		11.62	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	CSF1R	P07333	972 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	INPP5B	P32019	993 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	THEG	Q9P2T0	379 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.61	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027		H7C1W4	665 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	KSR2	Q6VAB6	950 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	SNX27	Q96L92	541 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	ASB2	Q96Q27	587 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	PICK1	Q9NRD5	415 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		11.59	□□□□□ -0.55
COPZ1-208	ENST00000550027	MSC	O60682	206 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	TAF5L	O75529	589 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.58	□□□□□ -0.56
COPZ1-208	ENST00000550027	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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