RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.82■■□□□ 1.88
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PUS1-211ENST00000544662 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.82■■□□□ 1.88
PUS1-211ENST00000544662 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PUS1-211ENST00000544662 MAP3K11Q16584 847 aa26.81■■□□□ 1.88
PUS1-211ENST00000544662 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.81■■□□□ 1.88
PUS1-211ENST00000544662 GAKO14976 1311 aa26.81■■□□□ 1.88
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PUS1-211ENST00000544662 RAB11FIP3O75154 756 aa26.79■■□□□ 1.88
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PUS1-211ENST00000544662 USP40Q9NVE5 1235 aa26.79■■□□□ 1.88
PUS1-211ENST00000544662 RAI14Q9P0K7 980 aa26.79■■□□□ 1.88
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PUS1-211ENST00000544662 OTOFQ9HC10 1997 aa26.75■■□□□ 1.87
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PUS1-211ENST00000544662 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.75■■□□□ 1.87
PUS1-211ENST00000544662 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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PUS1-211ENST00000544662 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.74■■□□□ 1.87
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PUS1-211ENST00000544662 BCL11AQ9H165 835 aa26.74■■□□□ 1.87
PUS1-211ENST00000544662 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.73■■□□□ 1.87
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PUS1-211ENST00000544662 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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PUS1-211ENST00000544662 ELP3Q9H9T3 547 aa26.67■■□□□ 1.86
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PUS1-211ENST00000544662 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 WRNIP1Q96S55 665 aa26.65■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.65■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 SAGE1Q9NXZ1 904 aa26.65■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 TRPA1O75762 1119 aa26.64■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 GJA5P36382 358 aa26.64■■□□□ 1.86
PUS1-211ENST00000544662 TM4SF4P48230 202 aa26.64■■□□□ 1.86
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