RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542776.5

POP5-208, Transcript of POP5 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, human

TSL 2

Gene POP5, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POP5-208	ENST00000542776	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	PTPN18	Q99952	460 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	SNRK	Q9NRH2	765 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	LAMB1	P07942	1786 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	MAST3	O60307	1309 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		12.1	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	INPP5B	P32019	993 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	MCAM	P43121	646 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	CAP1	Q01518	475 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	SSH3	Q8TE77	659 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	OPTN	Q96CV9	577 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	OTUD5	Q96G74	571 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	USP40	Q9NVE5	1235 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	AK9	Q5TCS8	1911 aa		12.09	□□□□□ -0.47
POP5-208	ENST00000542776	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SEMA3E	O15041	775 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	TNNI2	P48788	182 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MECOM	Q03112	1051 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	TNNI3K	Q59H18	835 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CEP85	Q6P2H3	762 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	IFNL1	Q8IU54	200 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	WRNIP1	Q96S55	665 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MRI	Q9BWK5	157 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	GAK	O14976	1311 aa		12.08	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	GPR25	O00155	361 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	BTD	P43251	543 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MAP3K9	P80192	1104 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SREBF2	Q12772	1141 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	GORAB	Q5T7V8	394 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FAM83A	Q86UY5	434 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	DOCK2	Q92608	1830 aa		12.07	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	RGS3	P49796	1198 aa		12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	PICALM	Q13492	652 aa		12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FAM196B	A6NMK8	535 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	APBB1	O00213	710 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CRHR2	Q13324	411 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	IRF6	O14896	467 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	ZAP70	P43403	619 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	SOX10	P56693	466 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	RHBDL3	P58872	404 aa		12.04	□□□□□ -0.48
POP5-208	ENST00000542776	CCL15	Q16663	113 aa		12.04	□□□□□ -0.48

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