RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.97□□□□□ -1.29
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.93□□□□□ -1.3
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 USP44Q9H0E7 712 aa6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.93□□□□□ -1.3
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