RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 POTEFA5A3E0 1075 aa28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 CETPP11597 493 aa28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 HTTP42858 3142 aa28.46■■■□□ 2.15
PKP3-210ENST00000533249 IRF6O14896 467 aa28.45■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 TCP10Q12799 353 aa28.45■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.45■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 FAM151AQ8WW52 585 aa28.45■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 SNAPC2Q13487 334 aa28.44■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 AK9Q5TCS8 1911 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 INPP5BP32019 993 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 PHKA1P46020 1223 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 PPIL2Q13356 520 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 MEIS3Q99687 375 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.43■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 BTBD19C9JJ37 291 aa28.42■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 NFIAQ12857 509 aa28.42■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF6Q15052 776 aa28.42■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 ARMC5Q96C12 935 aa28.42■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 USP40Q9NVE5 1235 aa28.41■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.41■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 ADORA1P30542 326 aa28.4■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.4■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 SEMA3EO15041 775 aa28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 TLR2O60603 784 aa28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 PPATQ06203 517 aa28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 COPRSQ9NQ92 184 aa28.39■■■□□ 2.14
PKP3-210ENST00000533249 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.39■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 CCDC102BQ68D86 513 aa28.38■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 FAM198AQ9UFP1 575 aa28.38■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.37■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa28.37■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 KIF22Q14807 665 aa28.36■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa28.36■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ZFPM1Q8IX07 1006 aa28.36■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.36■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 CENPFP49454 3210 aa28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 TIMM10P62072 90 aa28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ZNF333Q96JL9 665 aa28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.35■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 RASGRF1Q13972 1273 aa28.34■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 NBPF11Q86T75 865 aa28.34■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 ABCF2Q9UG63 623 aa28.34■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 SRGAP3O43295 1099 aa28.33■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 GNAI3P08754 354 aa28.33■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PKP3-210ENST00000533249 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 RGS3P49796 1198 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 TFCP2Q12800 502 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ANKRD23Q86SG2 305 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 MIER1Q8N108 512 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 CPA4Q9UI42 421 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.32■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 A0A1B0GUL7 405 aa28.31■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 PDHXO00330 501 aa28.31■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 DOCK2Q92608 1830 aa28.31■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 GAKO14976 1311 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 CCER2I3L3R5 266 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 C17orf99Q6UX52 265 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 XAGE2Q96GT9 111 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.3■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ZBTB22O15209 634 aa28.29■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ENTPD3O75355 529 aa28.29■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 IDI2Q9BXS1 227 aa28.29■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 SLF2Q8IX21 1173 aa28.28■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.28■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 ATRNL1Q5VV63 1379 aa28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 MTX1Q13505 466 aa28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 MOGSQ13724 837 aa28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 TNNQ9UQP3 1299 aa28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.26■■■□□ 2.12
PKP3-210ENST00000533249 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.26■■■□□ 2.11
PKP3-210ENST00000533249 GNRH1P01148 92 aa28.26■■■□□ 2.11
PKP3-210ENST00000533249 BTDP43251 543 aa28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms