RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-206ENST00000530405 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
PACSIN3-206ENST00000530405 MYPNQ86TC9 1320 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 RNF208Q9H0X6 261 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.64■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 COL6A3P12111 3177 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 MAST3O60307 1309 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ALDH1L1O75891 902 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 UBXN2AP68543 259 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.63■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A1W2PPC1 479 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 DLL1O00548 723 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 INPP5BP32019 993 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A0C4DFX4 3053 aa20.62■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 MOGSQ13724 837 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 KAZALD1Q96I82 304 aa20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 FCGRTP55899 365 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM151AQ8WW52 585 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SUCLG2Q96I99 432 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 MGAMO43451 1857 aa20.6■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 BCRP11274 1271 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 CAPN2P17655 700 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 PRKCZQ05513 592 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 LAMA3Q16787 3333 aa20.59■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 PDE8BO95263 885 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 SGPL1O95470 568 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 METTL24Q5JXM2 366 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.58■□□□□ 0.89
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF16BQ96L93 1317 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 BCAMP50895 628 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR63Q8IWG1 891 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.57■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 UTYO14607 1347 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CXCL11O14625 94 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 LRRC24Q50LG9 513 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 GABRQQ9UN88 632 aa20.56■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 AK9Q5TCS8 1911 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 EVI5O60447 810 aa20.55■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 ADCY3O60266 1144 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP2C8P10632 490 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC184Q52MB2 194 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 TCP10Q12799 353 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.53■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 FGFR2P21802 821 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 FLT3LGP49771 235 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 IRF5Q13568 498 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.52■□□□□ 0.88
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 INHAP05111 366 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 NFIAQ12857 509 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 LRCH3Q96II8 777 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 STAP2Q9UGK3 403 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.51■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ELNP15502 786 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 DEFB118Q96PH6 123 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.5■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 GPR153Q6NV75 609 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.49■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PACSIN3-206ENST00000530405 PTPRAP18433 802 aa20.48■□□□□ 0.87
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