RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527412.1

PRMT1-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 1, human

TSL 3

Gene PRMT1, Length 463 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT1-208	ENST00000527412	CASC1	Q6TDU7	716 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		10.16	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	POTEF	A5A3E0	1075 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	CDC45	O75419	566 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	CACNB3	P54284	484 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.15	□□□□□ -0.78
PRMT1-208	ENST00000527412	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	FKTN	O75072	461 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	HMMR	O75330	724 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MMP14	P50281	582 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CRHR2	Q13324	411 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MCM4	P33991	863 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	NF2	P35240	595 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SREBF2	Q12772	1141 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	LNPK	Q9C0E8	428 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ELP3	Q9H9T3	547 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	FGFR2	P21802	821 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CRK	P46108	304 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	BCAM	P50895	628 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.12	□□□□□ -0.79	1e-7	■■■□□ 18.2
PRMT1-208	ENST00000527412	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	USP44	Q9H0E7	712 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SLURP2	P0DP57	97 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	VGLL4	Q14135	290 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	RABEP1	Q15276	862 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CEP290	O15078	2479 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	HAX1	O00165	279 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CTGF	P29279	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	PDE8B	O95263	885 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MRE11	P49959	708 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	MOGS	Q13724	837 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PRMT1-208	ENST00000527412	UNCX	A6NJT0	531 aa		10.08	□□□□□ -0.8
PRMT1-208	ENST00000527412	REC8	O95072	547 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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