RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518426.1

CLVS1-202, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLVS1, Length 312 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-202ENST00000518426 SIN3BO75182 1162 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 CILPO75339 1184 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 HSD3B2P26439 372 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 KRT76Q01546 638 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 REC114Q7Z4M0 266 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 SVOPQ8N4V2 548 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 NAGPAQ9UK23 515 aa5.03□□□□□ -1.6
CLVS1-202ENST00000518426 C2CD2LO14523 706 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 TRIM37O94972 964 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ARNTP27540 789 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GIPRP48546 466 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CLCQ05315 142 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PERM1Q5SV97 790 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ADAM19Q9H013 955 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ZNRF3Q9ULT6 936 aa5.02□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MSTNO14793 375 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GRIN3BO60391 1043 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CDC25BP30305 580 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ADH7P40394 386 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CABP4P57796 275 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CHMP4BP1P59074 171 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 IKBKEQ14164 716 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PPP2R5EQ16537 467 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 DDR2Q16832 855 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 TNFRSF25Q93038 417 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa5.01□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ENPP3O14638 875 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 IMPDH2P12268 514 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MX2P20592 715 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 EPHA1P21709 976 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CDC27P30260 824 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SV2AQ7L0J3 742 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 Q8N3U1 123 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 OR6P1Q8NGX9 317 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SLC7A3Q8WY07 619 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 KCNB2Q92953 911 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GPATCH3Q96I76 525 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 DNAJC7Q99615 494 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CCDC113Q9H0I3 377 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PDPK1O15530 556 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ADH6P28332 368 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CDK8P49336 464 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GSTM4Q03013 218 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 AP3B2Q13367 1082 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PTPROQ16827 1216 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 RUFY4Q6ZNE9 571 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 PDZD3Q86UT5 571 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 NUDT8Q8WV74 236 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 KANSL2Q9H9L4 492 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 KLF15Q9UIH9 416 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 MSRB2Q9Y3D2 182 aa4.99□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 H3BRJ5 948 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 CDC45O75419 566 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 ARHGEF15O94989 841 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 FXNQ16595 210 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 HGSNATQ68CP4 663 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa4.98□□□□□ -1.61
CLVS1-202ENST00000518426 LILRB2Q8N423 598 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms