RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514702.1

HOXC-AS3-203, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 368 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PDHXO00330 501 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 INPP5BP32019 993 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TCP10Q12799 353 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ANKRD23Q86SG2 305 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NKX2-3Q8TAU0 364 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KLHDC4Q8TBB5 520 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TRIM47Q96LD4 638 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SRRDQ9UH36 339 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UTYO14607 1347 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MYPNQ86TC9 1320 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GRK4P32298 578 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 C17orf99Q6UX52 265 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FAM151AQ8WW52 585 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HTTP42858 3142 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ANP32CO43423 234 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLC5A1P13866 664 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 OSBPP22059 807 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MTFR1Q15390 333 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ANKRD44Q8N8A2 993 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KIF16BQ96L93 1317 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UBXN2AP68543 259 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RNF208Q9H0X6 261 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CCL5P13501 91 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CTGFP29279 349 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FCGRTP55899 365 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LPIN2Q92539 896 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 USP40Q9NVE5 1235 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DIXDC1Q155Q3 683 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FAM9BQ8IZU0 186 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SHISA4Q96DD7 197 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 KCNH4Q9UQ05 1017 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PTPRCP08575 1304 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EYA2O00167 538 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LDHBP07195 334 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GJB1P08034 283 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FGFR2P21802 821 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GJA8P48165 433 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PICK1Q9NRD5 415 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MGAMO43451 1857 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CYP2C8P10632 490 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PRKCZQ05513 592 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NFIAQ12857 509 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SLAIN1Q8ND83 568 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CENPFP49454 3210 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DOCK2Q92608 1830 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CXCL11O14625 94 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 USP44Q9H0E7 712 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZHX2Q9Y6X8 837 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 PRDX5P30044 214 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ATP2B3Q16720 1220 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SIL1Q9H173 461 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 FAM198AQ9UFP1 575 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ADCY3O60266 1144 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 BCRP11274 1271 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MOGSQ13724 837 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DENND2AQ9ULE3 1009 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 GABRQQ9UN88 632 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 EVI5O60447 810 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 SGPL1O95470 568 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 RGS3P49796 1198 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-203ENST00000514702 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms