RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513020.5

SH3BP2-224, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 868 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-224ENST00000513020 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP2-224ENST00000513020 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-224ENST00000513020 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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SH3BP2-224ENST00000513020 AACSQ86V21 672 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-224ENST00000513020 CCDC102AQ96A19 550 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-224ENST00000513020 TEPSINQ96N21 525 aa14.66□□□□□ -0.06
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SH3BP2-224ENST00000513020 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.65□□□□□ -0.06
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SH3BP2-224ENST00000513020 FAM83AQ86UY5 434 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF384Q8TF68 577 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 USP40Q9NVE5 1235 aa14.64□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 BTDP43251 543 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 ZAP70P43403 619 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 TCP10Q12799 353 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 NFIAQ12857 509 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 SLF2Q8IX21 1173 aa14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 DOCK2Q92608 1830 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB11FIP3O75154 756 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 TSKSQ9UJT2 592 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 AK9Q5TCS8 1911 aa14.62□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 GSTO1P78417 241 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 FAM151AQ8WW52 585 aa14.61□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 LAMB1P07942 1786 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 LBX1P52954 281 aa14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa14.6□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.59□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 IDI2Q9BXS1 227 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-224ENST00000513020 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.59□□□□□ -0.07
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SH3BP2-224ENST00000513020 SPRYD7Q5W111 196 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP2-224ENST00000513020 ELP3Q9H9T3 547 aa14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP2-224ENST00000513020 FOCADQ5VW36 1801 aa14.57□□□□□ -0.08
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SH3BP2-224ENST00000513020 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 DCTPP1Q9H773 170 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 TRPA1O75762 1119 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 GJA5P36382 358 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 MAP3K9P80192 1104 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-224ENST00000513020 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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