RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495040.1

PLXNA3-208, Transcript of plexin A3, human

TSL 5

Gene PLXNA3, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPR25	O00155	361 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	GJA5	P36382	358 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	OPTN	Q96CV9	577 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	CSAD	Q9Y600	493 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM151A	Q8WW52	585 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		32.9	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	VGLL4	Q14135	290 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PLXNA3-208	ENST00000495040	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	POLA2	Q14181	598 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	DCAF15	Q66K64	600 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	32.87	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	RLBP1	P12271	317 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	SLF2	Q8IX21	1173 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.86	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	FKTN	O75072	461 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	GAK	O14976	1311 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	TCP10	Q12799	353 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	WRNIP1	Q96S55	665 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	NFIA	Q12857	509 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.83	■■■□□ 2.85
PLXNA3-208	ENST00000495040	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	GTF2A2	P52657	109 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	SPATA5	Q8NB90	893 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	OTUD5	Q96G74	571 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	PTPN18	Q99952	460 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		32.81	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	ERO1B	Q86YB8	467 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	ENTPD3	O75355	529 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	MS4A1	P11836	297 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	RGS19	P49795	217 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	MECOM	Q03112	1051 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCL15	Q16663	113 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PLXNA3-208	ENST00000495040	BTD	P43251	543 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	RGS3	P49796	1198 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	CRHR2	Q13324	411 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	PI16	Q6UXB8	463 aa		32.76	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	MCAM	P43121	646 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	GSTO1	P78417	241 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	LDHC	P07864	332 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	INPP5B	P32019	993 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	CETP	P11597	493 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	PPAT	Q06203	517 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	PPIL2	Q13356	520 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	RAI14	Q9P0K7	980 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	DOCK2	Q92608	1830 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	IRF6	O14896	467 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	CEP85	Q6P2H3	762 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	ZNF384	Q8TF68	577 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PLXNA3-208	ENST00000495040	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83

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