RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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TRDMT1-211ENST00000495022 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB22O15209 634 aa28.09■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.09■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.08■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SEMA3EO15041 775 aa28.08■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CETPP11597 493 aa28.08■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.08■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM151AQ8WW52 585 aa28.08■■■□□ 2.09
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TRDMT1-211ENST00000495022 PRDX5P30044 214 aa28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 PPIL2Q13356 520 aa28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF341Q9BYN7 854 aa28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 COPRSQ9NQ92 184 aa28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.07■■■□□ 2.08
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TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.06■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 CCER2I3L3R5 266 aa28.05■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 IRF6O14896 467 aa28.05■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
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TRDMT1-211ENST00000495022 SNAPC2Q13487 334 aa28.05■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ARMC5Q96C12 935 aa28.05■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 PHKA1P46020 1223 aa28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 MEIS3Q99687 375 aa28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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TRDMT1-211ENST00000495022 MIGA2Q7L4E1 593 aa28.03■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF112Q9UJU3 913 aa28.02■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa28.02■■■□□ 2.08
TRDMT1-211ENST00000495022 BTBD19C9JJ37 291 aa28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 TLR2O60603 784 aa28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 NFIAQ12857 509 aa28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 GNAI3P08754 354 aa28■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 INPP5BP32019 993 aa28■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 TCP10Q12799 353 aa28■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC102BQ68D86 513 aa28■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM198AQ9UFP1 575 aa28■■■□□ 2.07
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TRDMT1-211ENST00000495022 POTEFA5A3E0 1075 aa27.99■■■□□ 2.07
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TRDMT1-211ENST00000495022 USP40Q9NVE5 1235 aa27.99■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 MTX1Q13505 466 aa27.99■■■□□ 2.07
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TRDMT1-211ENST00000495022 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.96■■■□□ 2.07
TRDMT1-211ENST00000495022 GNRH1P01148 92 aa27.95■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 TIMM10P62072 90 aa27.95■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 DOCK1Q14185 1865 aa27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A1B0GUL7 405 aa27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 ENTPD3O75355 529 aa27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 CEP290O15078 2479 aa27.94■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.93■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 RGS3P49796 1198 aa27.92■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 C17orf99Q6UX52 265 aa27.92■■■□□ 2.06
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TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM27P14373 513 aa27.9■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 PRMT2P55345 433 aa27.9■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 MOGSQ13724 837 aa27.9■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRA2Q96PE1 1338 aa27.89■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.89■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 CXCL11O14625 94 aa27.89■■■□□ 2.06
TRDMT1-211ENST00000495022 EN2P19622 333 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
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