RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495004.1

PDIA5-208, Transcript of protein disulfide isomerase family A member 5, human

TSL 3

Gene PDIA5, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDIA5-208	ENST00000495004	PPIL2	Q13356	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	JAG2	Q9Y219	1238 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	AOX1	Q06278	1338 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	ZBTB22	O15209	634 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PPAT	Q06203	517 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	OTUD5	Q96G74	571 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	KAZALD1	Q96I82	304 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	WRNIP1	Q96S55	665 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	MEIS3	Q99687	375 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	HTT	P42858	3142 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	HOXD10	P28358	340 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PDE3A	Q14432	1141 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	OTOF	Q9HC10	1997 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	LPIN2	Q92539	896 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	TNN	Q9UQP3	1299 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PDIA5-208	ENST00000495004	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SLC5A1	P13866	664 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	FGFR2	P21802	821 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	FAM151A	Q8WW52	585 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	BTBD19	C9JJ37	291 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	IRF6	O14896	467 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SEMA3E	O15041	775 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	RLBP1	P12271	317 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	EYA2	O00167	538 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	BCAM	P50895	628 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	C17orf99	Q6UX52	265 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CXCL11	O14625	94 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	HMMR	O75330	724 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CIAO1	O76071	339 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	GRIK5	Q16478	980 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SIL1	Q9H173	461 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SRRD	Q9UH36	339 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CAP1	Q01518	475 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	MTX1	Q13505	466 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SLF2	Q8IX21	1173 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	PDHX	O00330	501 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CACNB3	P54284	484 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	UBXN2A	P68543	259 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	TRIM47	Q96LD4	638 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	ENTPD3	O75355	529 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	GRK4	P32298	578 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	PSMC4	P43686	418 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	FCGRT	P55899	365 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PDIA5-208	ENST00000495004	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		12.71	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms