RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K9P80192 1104 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 NFIAQ12857 509 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 VGLL4Q14135 290 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 PI16Q6UXB8 463 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 USP40Q9NVE5 1235 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 OTOFQ9HC10 1997 aa22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 TCP10Q12799 353 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 OPTNQ96CV9 577 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 GAKO14976 1311 aa22.22■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 TNNI3KQ59H18 835 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 CEP85Q6P2H3 762 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 IFNL1Q8IU54 200 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 SPATA5Q8NB90 893 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 FAM151AQ8WW52 585 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRU-207ENST00000492954 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 INHBEP58166 350 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 HOOK2Q96ED9 719 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 WRNIP1Q96S55 665 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 GPR108Q9NPR9 543 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 CSADQ9Y600 493 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MCAMP43121 646 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MECOMQ03112 1051 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 GPR25O00155 361 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ALDH1A1P00352 501 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MS4A1P11836 297 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 DCAF15Q66K64 600 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 SLF2Q8IX21 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF384Q8TF68 577 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 OTUD5Q96G74 571 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 BTDP43251 543 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 PTPN18Q99952 460 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 RGS3P49796 1198 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 IDI2Q9BXS1 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 SNRKQ9NRH2 765 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 COG6Q9Y2V7 657 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 LAMB1P07942 1786 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRU-207ENST00000492954 INPP5BP32019 993 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 RAI14Q9P0K7 980 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 FKTNO75072 461 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ENTPD3O75355 529 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 GTF2A2P52657 109 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ERO1BQ86YB8 467 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 RHBDL3P58872 404 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 GSTO1P78417 241 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CRHR2Q13324 411 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 PICALMQ13492 652 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 CCL15Q16663 113 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRU-207ENST00000492954 LDHCP07864 332 aa22.11■■□□□ 1.13
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