RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485941.2

NBPF3-211, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NBPF3, Length 921 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-211ENST00000485941 PPIL2Q13356 520 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 FAM151AQ8WW52 585 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.12■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 CIAO1O76071 339 aa29.11■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 HOOK2Q96ED9 719 aa29.11■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.11■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 INPP5BP32019 993 aa29.1■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.1■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 PRDX5P30044 214 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 NFIAQ12857 509 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 SNAPC2Q13487 334 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 DCAF15Q66K64 600 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.09■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 PPATQ06203 517 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.08■■■□□ 2.25
NBPF3-211ENST00000485941 MOGSQ13724 837 aa29.07■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.07■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.07■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGEF6Q15052 776 aa29.06■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ATP2B3Q16720 1220 aa29.06■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 C17orf99Q6UX52 265 aa29.06■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.05■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.05■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 SIL1Q9H173 461 aa29.05■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 CTGFP29279 349 aa29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 PHKA1P46020 1223 aa29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 TCP10Q12799 353 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 COPRSQ9NQ92 184 aa29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 SEMA3EO15041 775 aa29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.01■■■□□ 2.24
NBPF3-211ENST00000485941 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.01■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 GAKO14976 1311 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 GNRH1P01148 92 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 ADORA1P30542 326 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 NBPF11Q86T75 865 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 GCC1Q96CN9 775 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 USP40Q9NVE5 1235 aa29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 PHF20L1A8MW92 1017 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 MAP3K10Q02779 954 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 MEIS3Q99687 375 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 IDI2Q9BXS1 227 aa28.99■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 CCDC102BQ68D86 513 aa28.98■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa28.98■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 PDHXO00330 501 aa28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 PRMT2P55345 433 aa28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 GPAT2Q6NUI2 795 aa28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 SH3TC2Q8TF17 1288 aa28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 CPA4Q9UI42 421 aa28.97■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 TRIM47Q96LD4 638 aa28.96■■■□□ 2.23
NBPF3-211ENST00000485941 ENTPD3O75355 529 aa28.95■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 RASGRF1Q13972 1273 aa28.95■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 KIF22Q14807 665 aa28.95■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 CXCL11O14625 94 aa28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 RGS3P49796 1198 aa28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 TIMM10P62072 90 aa28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 MTX1Q13505 466 aa28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 SRRDQ9UH36 339 aa28.94■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.93■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 BCRP11274 1271 aa28.93■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 ZNF384Q8TF68 577 aa28.93■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.93■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 SLURP2P0DP57 97 aa28.92■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 PSMC4P43686 418 aa28.92■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.92■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 AK9Q5TCS8 1911 aa28.91■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 OSBPP22059 807 aa28.91■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.91■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
NBPF3-211ENST00000485941 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms