RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 FAM151AQ8WW52 585 aa27.54■■■□□ 2
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PTPRN-215ENST00000484986 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.52■■■□□ 2
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PTPRN-215ENST00000484986 SLF2Q8IX21 1173 aa27.45■■□□□ 1.98
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PTPRN-215ENST00000484986 CAP1Q01518 475 aa27.44■■□□□ 1.98
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PTPRN-215ENST00000484986 MYH13Q9UKX3 1938 aa27.43■■□□□ 1.98
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PTPRN-215ENST00000484986 IDI2Q9BXS1 227 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRN-215ENST00000484986 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.41■■□□□ 1.98
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PTPRN-215ENST00000484986 XAGE2Q96GT9 111 aa27.38■■□□□ 1.97
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PTPRN-215ENST00000484986 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.34■■□□□ 1.97
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PTPRN-215ENST00000484986 CPA4Q9UI42 421 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 BRCA2P51587 3418 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PTPRN-215ENST00000484986 PHF20L1A8MW92 1017 aa27.33■■□□□ 1.97
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