RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481518.1

PSME4-208, Transcript of proteasome activator subunit 4, human

TSL 5

Gene PSME4, Length 886 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME4-208	ENST00000481518	NFIA	Q12857	509 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PSME4-208	ENST00000481518	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PSME4-208	ENST00000481518	TNNI3K	Q59H18	835 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PSME4-208	ENST00000481518	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
PSME4-208	ENST00000481518	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PSME4-208	ENST00000481518	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		28.39	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	GPR108	Q9NPR9	543 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	GAK	O14976	1311 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	TBC1D8	O95759	1140 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	28.37	■■■□□ 2.13	5e-6	■■□□□ 11.5
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF384	Q8TF68	577 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	ABHD8	Q96I13	439 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MCAM	P43121	646 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	TCP10	Q12799	353 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	VGLL4	Q14135	290 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.35	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MS4A1	P11836	297 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MAP3K9	P80192	1104 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	FAM151A	Q8WW52	585 aa		28.35	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MECOM	Q03112	1051 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	OPTN	Q96CV9	577 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		28.33	■■■□□ 2.13
PSME4-208	ENST00000481518	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	DGKZ	Q13574	1117 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	IFNL1	Q8IU54	200 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	WRNIP1	Q96S55	665 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	BTD	P43251	543 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	INHBE	P58166	350 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	SLF2	Q8IX21	1173 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	HOOK2	Q96ED9	719 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	SNRK	Q9NRH2	765 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	CSAD	Q9Y600	493 aa		28.3	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	RGS3	P49796	1198 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	DCAF15	Q66K64	600 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	IDI2	Q9BXS1	227 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	OTUD5	Q96G74	571 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	PTPN18	Q99952	460 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	GPR25	O00155	361 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	RHBDL3	P58872	404 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	RAI14	Q9P0K7	980 aa		28.27	■■■□□ 2.12
PSME4-208	ENST00000481518	ENTPD3	O75355	529 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ALDH1A1	P00352	501 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	INPP5B	P32019	993 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	DOCK2	Q92608	1830 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		28.26	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	GSTO1	P78417	241 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	ZAP70	P43403	619 aa		28.23	■■■□□ 2.11
PSME4-208	ENST00000481518	PICALM	Q13492	652 aa		28.23	■■■□□ 2.11

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms