RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 AOC2O75106 756 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 ZAP70P43403 619 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 GSTO1P78417 241 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FAM83AQ86UY5 434 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 NOGQ13253 232 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 CCDC102AQ96A19 550 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FZD1Q9UP38 647 aa25.42■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FOCADQ5VW36 1801 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 MAP2K2P36507 400 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 BTDP43251 543 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 ZNF384Q8TF68 577 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 TEPSINQ96N21 525 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 USP40Q9NVE5 1235 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 MYH7P12883 1935 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 LAMB1P07942 1786 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 SLC10A3P09131 477 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 DCTPP1Q9H773 170 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 LDHCP07864 332 aa25.39■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.39■■□□□ 1.66
NELFE-208ENST00000481121 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.38■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 NFIAQ12857 509 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K11Q16584 847 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 AIDAQ96BJ3 306 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 TCP10Q12799 353 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 AAMPQ13685 434 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 FAM151AQ8WW52 585 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 IGSF3O75054 1194 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 HOOK2Q96ED9 719 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 WBP1LQ9NX94 342 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.36■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 ZIC5Q96T25 663 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 IDI2Q9BXS1 227 aa25.34■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 RGS3P49796 1198 aa25.33■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.33■■□□□ 1.65
NELFE-208ENST00000481121 UNCXA6NJT0 531 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ENTPD3O75355 529 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 RHBDL3P58872 404 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MAP3K12Q12852 859 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 PICALMQ13492 652 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 FOXN1O15353 648 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 BAG3O95817 575 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ATP5JP18859 108 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 DCAF15Q66K64 600 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 GOLIM4O00461 696 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 SLC10A4Q96EP9 437 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MYH1P12882 1939 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 GPATCH3Q96I76 525 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 PLCG2P16885 1265 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 CYP7A1P22680 504 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 TEX11Q8IYF3 940 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-208ENST00000481121 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.648e-8■□□□□ 9.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms