RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 VGLL4Q14135 290 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CCL15Q16663 113 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC24Q50LG9 513 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 HTTP42858 3142 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.69□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A10Q6U841 1118 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 GCC1Q96CN9 775 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF333Q96JL9 665 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ALDH1L1O75891 902 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 BCAMP50895 628 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 GTF2A2P52657 109 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 TNFAIP1Q13829 316 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 OTUD5Q96G74 571 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 MYH3P11055 1940 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 BTBD19C9JJ37 291 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 MRS2Q9HD23 443 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CENPFP49454 3210 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 IRF6O14896 467 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CTGFP29279 349 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 TNNI2P48788 182 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD10Q14728 455 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 MIGA2Q7L4E1 593 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 CSADQ9Y600 493 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-208ENST00000479480 UTYO14607 1347 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 TLR2O60603 784 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PDE8BO95263 885 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 METTL24Q5JXM2 366 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF11Q86T75 865 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 VPS37DQ86XT2 251 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 ERO1BQ86YB8 467 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 WRNIP1Q96S55 665 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 MRIQ9BWK5 157 aa10.64□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 CETPP11597 493 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 FGFR2P21802 821 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 INPP5BP32019 993 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF6Q15052 776 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 MTFR1Q15390 333 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 IER5LQ5T953 404 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 C17orf99Q6UX52 265 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 TEKT1Q969V4 418 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 CPA4Q9UI42 421 aa10.63□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 BRCA2P51587 3418 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 H0YGN5 161 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PPIL2Q13356 520 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 SNAPC2Q13487 334 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 MOGSQ13724 837 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 FAM83AQ86UY5 434 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.62□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PSMC4P43686 418 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PPATQ06203 517 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 TCP10Q12799 353 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP1CQ5VVH2 108 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 HHIPL2Q6UWX4 724 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 ZFPM1Q8IX07 1006 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM47Q96LD4 638 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 USP44Q9H0E7 712 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF112Q9UJU3 913 aa10.61□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 PDHXO00330 501 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 SLURP2P0DP57 97 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 NFIAQ12857 509 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 KIF22Q14807 665 aa10.6□□□□□ -0.71
CTPS1-208ENST00000479480 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms