RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476860.1

MFSD1-211, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 460 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-211ENST00000476860 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 RNF208Q9H0X6 261 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 BCL11AQ9H165 835 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 MRS2Q9HD23 443 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 AK5Q9Y6K8 562 aa6.57□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 USP17L7P0C7H9 530 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 BMP3P12645 472 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 PCDH1Q08174 1060 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 IKBKEQ14164 716 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.56□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 MEGF11A6BM72 1044 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 SORBS3O60504 671 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 ITGAEP38570 1179 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 MSMPQ1L6U9 139 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 BEND4Q6ZU67 534 aa6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 HGSNATQ68CP4 663 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 CRELD1Q96HD1 420 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.54□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 B3GALT4O96024 378 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 PRNPP04156 253 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 FAAP100Q0VG06 881 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 CBLL1Q75N03 491 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 PIM2Q9P1W9 311 aa6.53□□□□□ -1.36
MFSD1-211ENST00000476860 TIAF1O95411 115 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ARL4DP49703 201 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 UNCXA6NJT0 531 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 WDR64B1ANS9 1081 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 FBXO24O75426 580 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 CTSHP09668 335 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 FZD5Q13467 585 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ABI1Q8IZP0 508 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.51□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 NLRP12P59046 1061 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 GSTM4Q03013 218 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 FDX2Q6P4F2 183 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF428Q96B54 188 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 CEP44Q9C0F1 390 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.5□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 F13BP05160 661 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 FOSL1P15407 271 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SGO2Q562F6 1265 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 USP26Q9BXU7 913 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.49□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 JAG1P78504 1218 aa6.48□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ENC1O14682 589 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 RECKO95980 971 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 CELA3AP09093 270 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 VAMP1P23763 118 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 AP3B2Q13367 1082 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SV2BQ7L1I2 683 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.47□□□□□ -1.37
MFSD1-211ENST00000476860 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
MFSD1-211ENST00000476860 CYP11A1P05108 521 aa6.46□□□□□ -1.38
MFSD1-211ENST00000476860 ITGB5P18084 799 aa6.46□□□□□ -1.38
MFSD1-211ENST00000476860 MAOBP27338 520 aa6.46□□□□□ -1.38
MFSD1-211ENST00000476860 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.46□□□□□ -1.38
MFSD1-211ENST00000476860 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.46□□□□□ -1.38
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