RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 CAP1Q01518 475 aa23.95■■□□□ 1.42
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SHQ1-206ENST00000471526 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.95■■□□□ 1.42
SHQ1-206ENST00000471526 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.95■■□□□ 1.42
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SHQ1-206ENST00000471526 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.88■■□□□ 1.41
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SHQ1-206ENST00000471526 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.82■■□□□ 1.4
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SHQ1-206ENST00000471526 GAKO14976 1311 aa23.82■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 ENTPD3O75355 529 aa23.81■■□□□ 1.4
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SHQ1-206ENST00000471526 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.8■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.8■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 MECOMQ03112 1051 aa23.79■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.79■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.79■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.78■■□□□ 1.4
SHQ1-206ENST00000471526 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
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