RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-208ENST00000470089 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa35.96■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.96■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa35.96■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 LDLRAD1Q5T700 205 aa35.95■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
FBXO18-208ENST00000470089 RHPN1Q8TCX5 695 aa35.94■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 MECOMQ03112 1051 aa35.93■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 AACSQ86V21 672 aa35.93■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 USP40Q9NVE5 1235 aa35.93■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 GAKO14976 1311 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 USP2O75604 605 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 MAP3K11Q16584 847 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 FKBP1CQ5VVH2 108 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 FAM83AQ86UY5 434 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 BCL11AQ9H165 835 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 TSKSQ9UJT2 592 aa35.92■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 LBX1P52954 281 aa35.91■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 RAI14Q9P0K7 980 aa35.91■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 OTOFQ9HC10 1997 aa35.91■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 AK9Q5TCS8 1911 aa35.91■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 SLF2Q8IX21 1173 aa35.9■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF384Q8TF68 577 aa35.9■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 CLMNQ96JQ2 1002 aa35.9■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 IREB2P48200 963 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 TCP10Q12799 353 aa35.89■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 NFIAQ12857 509 aa35.89■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 KIF1BPQ96EK5 621 aa35.89■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 LRP2BPQ9P2M1 347 aa35.89■■■■□ 3.34
FBXO18-208ENST00000470089 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa35.88■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 CSRNP1Q96S65 589 aa35.88■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 BTDP43251 543 aa35.87■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 ZAP70P43403 619 aa35.87■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.87■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 FAM198AQ9UFP1 575 aa35.86■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 RAB11FIP3O75154 756 aa35.85■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 FAM151AQ8WW52 585 aa35.85■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 MAST2Q6P0Q8 1798 aa35.84■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 GSTO1P78417 241 aa35.84■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa35.83■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 PRDM10Q9NQV6 1147 aa35.83■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa35.83■■■■□ 3.33
FBXO18-208ENST00000470089 CA12O43570 354 aa35.82■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 LDHCP07864 332 aa35.82■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 SPRYD7Q5W111 196 aa35.82■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 ZFPM1Q8IX07 1006 aa35.82■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa35.81■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 RGS3P49796 1198 aa35.81■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 WNK4Q96J92 1243 aa35.8■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 UNCXA6NJT0 531 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 MIGA2Q7L4E1 593 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 CRBNQ96SW2 442 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 IDI2Q9BXS1 227 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 ELP3Q9H9T3 547 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 RNF186Q9NXI6 227 aa35.79■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 RFX7Q2KHR2 1363 aa35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 TRPA1O75762 1119 aa35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 RHBDL3P58872 404 aa35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 HOOK2Q96ED9 719 aa35.78■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 MAP3K9P80192 1104 aa35.77■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 PICALMQ13492 652 aa35.77■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 DOCK2Q92608 1830 aa35.76■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 VGLL4Q14135 290 aa35.76■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 DCAF15Q66K64 600 aa35.76■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 ANTXR1Q9H6X2 564 aa35.76■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.76■■■■□ 3.32
FBXO18-208ENST00000470089 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 ENTPD3O75355 529 aa35.75■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 GJA5P36382 358 aa35.75■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 WRNIP1Q96S55 665 aa35.75■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.75■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 TNS4Q8IZW8 715 aa35.74■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 LRRCC1Q9C099 1032 aa35.74■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 SAGE1Q9NXZ1 904 aa35.74■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 CSADQ9Y600 493 aa35.74■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 IDH1O75874 414 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 OPTNQ96CV9 577 aa35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
FBXO18-208ENST00000470089 ZNF341Q9BYN7 854 aa35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms