RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	GSTO1	P78417	241 aa		21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	PRKG1	Q13976	671 aa		21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	USP40	Q9NVE5	1235 aa		21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		21.66	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	MAP2K2	P36507	400 aa		21.65	■■□□□ 1.06
USP19-210	ENST00000465902	LDHC	P07864	332 aa		21.64	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		21.64	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	21.64	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		21.64	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	MOB2	Q70IA6	237 aa		21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	TNS4	Q8IZW8	715 aa		21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	21.63	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	BTD	P43251	543 aa		21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	21.62	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	GAK	O14976	1311 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	AOC2	O75106	756 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	FKBP1B	P68106	108 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	TCP10	Q12799	353 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF384	Q8TF68	577 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	GPATCH3	Q96I76	525 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	21.61	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	GOLIM4	O00461	696 aa		21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	GCC1	Q96CN9	775 aa		21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	FZD1	Q9UP38	647 aa		21.6	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ATP5J	P18859	108 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	LBX1	P52954	281 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K12	Q12852	859 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	RGMB	Q6NW40	437 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	FAM83A	Q86UY5	434 aa		21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	21.59	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	DOCK2	Q92608	1830 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	NFIA	Q12857	509 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		21.58	■■□□□ 1.05
USP19-210	ENST00000465902	BAG3	O95817	575 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	CYP7A1	P22680	504 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	NOG	Q13253	232 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	PICALM	Q13492	652 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM151A	Q8WW52	585 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	TEPSIN	Q96N21	525 aa		21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	21.57	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	RGS3	P49796	1198 aa		21.56	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		21.56	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		21.56	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	21.56	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		21.56	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	IGHD	P01880	384 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	CCDC102A	Q96A19	550 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	HAUS7	Q99871	368 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	MYH7	P12883	1935 aa		21.55	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	IGSF3	O75054	1194 aa		21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	TEX11	Q8IYF3	940 aa		21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	HOOK2	Q96ED9	719 aa		21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	ZIC5	Q96T25	663 aa		21.54	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	CA12	O43570	354 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	PLCG2	P16885	1265 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	RHBDL3	P58872	404 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		21.53	■■□□□ 1.04
USP19-210	ENST00000465902	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04

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