RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 USP40Q9NVE5 1235 aa29.4■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 TCP10Q12799 353 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 NFIAQ12857 509 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE3AQ14432 1141 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K11Q16584 847 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF384Q8TF68 577 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBTB22O15209 634 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 MECOMQ03112 1051 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 RNF186Q9NXI6 227 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 OTOFQ9HC10 1997 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPA1O75762 1119 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC158Q5M9N0 1113 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 SPRYD7Q5W111 196 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 RAI14Q9P0K7 980 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 GAKO14976 1311 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 BTDP43251 543 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM83AQ86UY5 434 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 AACSQ86V21 672 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 ELP3Q9H9T3 547 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 GJA5P36382 358 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 ZAP70P43403 619 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 RHPN1Q8TCX5 695 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 WNK4Q96J92 1243 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CA12O43570 354 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 HMMRO75330 724 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 ERC1Q8IUD2 1116 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM151AQ8WW52 585 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 AK9Q5TCS8 1911 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 RGS3P49796 1198 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 SLF2Q8IX21 1173 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 SLURP2P0DP57 97 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K9P80192 1104 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 PICALMQ13492 652 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 VGLL4Q14135 290 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.28■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SH3BP5-208ENST00000459627 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 TBC1D8O95759 1140 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 TM4SF4P48230 202 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 RHBDL3P58872 404 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 OPTNQ96CV9 577 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF1BPQ96EK5 621 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 WRNIP1Q96S55 665 aa29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 GSTO1P78417 241 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.25■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 LDHCP07864 332 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 IDI2Q9BXS1 227 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.24■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 INPP5BP32019 993 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SREBF2Q12772 1141 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 CSADQ9Y600 493 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 DCAF15Q66K64 600 aa29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
SH3BP5-208ENST00000459627 OTUD5Q96G74 571 aa29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms