RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444498.5

NME4-205, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3

Gene NME4, Length 1,111 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-205ENST00000444498 SLF2Q8IX21 1173 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 GAKO14976 1311 aa23.03■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 HMMRO75330 724 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 IFFO2Q5TF58 517 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 TNS4Q8IZW8 715 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 TSKSQ9UJT2 592 aa23.02■■□□□ 1.28
NME4-205ENST00000444498 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 SPRYD7Q5W111 196 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 USP40Q9NVE5 1235 aa23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 MECOMQ03112 1051 aa23■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 HOOK2Q96ED9 719 aa23■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 RNF186Q9NXI6 227 aa23■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 FAM151AQ8WW52 585 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 TM4SF4P48230 202 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 NFIAQ12857 509 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 ZNF384Q8TF68 577 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 TRPA1O75762 1119 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 GSTO1P78417 241 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 WNK4Q96J92 1243 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 LDHCP07864 332 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 MAP3K9P80192 1104 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 SREBF2Q12772 1141 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 TCP10Q12799 353 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 AACSQ86V21 672 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.275e-9■■■□□ 17.3
NME4-205ENST00000444498 IDI2Q9BXS1 227 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 SNRKQ9NRH2 765 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 RAI14Q9P0K7 980 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-205ENST00000444498 BTDP43251 543 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 DCAF15Q66K64 600 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 IGSF3O75054 1194 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 RAB11FIP3O75154 756 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ENTPD3O75355 529 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 INHBEP58166 350 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 VGLL4Q14135 290 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ELP3Q9H9T3 547 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 CSADQ9Y600 493 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 GJA5P36382 358 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ZAP70P43403 619 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 RGS3P49796 1198 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 RHBDL3P58872 404 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 OTOFQ9HC10 1997 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 APBB1O00213 710 aa22.91■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.91■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 OPTNQ96CV9 577 aa22.91■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 WRNIP1Q96S55 665 aa22.91■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.91■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NME4-205ENST00000444498 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.89■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.89■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 ALDH1A1P00352 501 aa22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 IFNL1Q8IU54 200 aa22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.88■■□□□ 1.25
NME4-205ENST00000444498 LAMB1P07942 1786 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms