RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 GMCL1Q96IK5 515 aa8.91□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.91□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 ZFATQ9P243 1243 aa8.91□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.91□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 PHACTR2O75167 634 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 RECKO95980 971 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 IRS1P35568 1242 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 SLC30A3Q99726 388 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 MARK1Q9P0L2 795 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 MYOM1P52179 1685 aa8.9□□□□□ -0.98
MED28P4-201ENST00000433137 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 GPR25O00155 361 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 EREGO14944 169 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 DAB2P98082 770 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SPEM2Q0P670 501 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PI16Q6UXB8 463 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 TMC4Q7Z404 712 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 FBF1Q8TES7 1133 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.89□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 USP6P35125 1406 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CDC14CA4D256 554 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 MMP20O60882 483 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PIP4K2BP78356 416 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 FGD1P98174 961 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 ITSN1Q15811 1721 aa8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SBNO1A3KN83 1393 aa8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 AKAP12Q02952 1782 aa8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NFKB1P19838 968 aa8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PXDNQ92626 1479 aa8.87□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 USP31Q70CQ4 1352 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 RARAP10276 462 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 FGFR3P22607 806 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 GNA15P30679 374 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CTBSQ01459 385 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PSMD2Q13200 908 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NME9Q86XW9 330 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 BACH2Q9BYV9 841 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NPHS2Q9NP85 383 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 KIF1AQ12756 1690 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 CES1P23141 567 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 VEGFBP49765 207 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 FAM182BQ5T319 152 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 OR13H1Q8NG92 308 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 BHMTQ93088 406 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.85□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SORBS3O60504 671 aa8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 SV2AQ7L0J3 742 aa8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 FBXO41Q8TF61 875 aa8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PNMA5Q96PV4 448 aa8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
MED28P4-201ENST00000433137 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 C2CD2LO14523 706 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 MAP3K6O95382 1288 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 GCP02774 474 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 FBLN1P23142 703 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 HSPA1LP34931 641 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 MRS2Q9HD23 443 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 PHF24Q9UPV7 400 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 AK5Q9Y6K8 562 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 NSD2O96028 1365 aa8.83□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 CTSHP09668 335 aa8.82□□□□□ -1
MED28P4-201ENST00000433137 RALBP1Q15311 655 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms