RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 PDE1AP54750 535 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 DBN1Q16643 649 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 ERFEQ4G0M1 354 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 CD163Q86VB7 1156 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 NGLY1Q96IV0 654 aa7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 CDC45O75419 566 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA1LP34931 641 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 TCIRG1Q13488 830 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 DDRGK1Q96HY6 314 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 C8orf37Q96NL8 207 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 COPRSQ9NQ92 184 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 ATRNO75882 1429 aa7.41□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 SDSP20132 328 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 MX1P20591 662 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 MX2P20592 715 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 FOXO4P98177 505 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 USP21Q9UK80 565 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.4□□□□□ -1.22
C6orf48-208ENST00000395788 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087WZG4 1122 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 SASH1O94885 1247 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 SIK1P57059 783 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GRIN2CQ14957 1233 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.39□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PALLDQ8WX93 1383 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CDHR2Q9BYE9 1310 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CHRNA4P43681 627 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ITPK1Q13572 414 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KIF6Q6ZMV9 814 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 AFF2P51816 1311 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 APBB1O00213 710 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 KCNQ2O43526 872 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CSF1RP07333 972 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF34Q8IZ26 560 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.235e-16■□□□□ 10.1
C6orf48-208ENST00000395788 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 IL17RAQ96F46 866 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.37□□□□□ -1.23
C6orf48-208ENST00000395788 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms