RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP7Q14244 749 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 USPL1Q5W0Q7 1092 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGFL4Q6B9Z1 124 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OGFOD3Q6PK18 319 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM35AQ86V20 835 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF276Q8N554 614 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RHBDD1Q8TEB9 315 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NELL1Q92832 810 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF414Q96IQ9 312 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PWWP2AQ96N64 755 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC30A3Q99726 388 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CD248Q9HCU0 757 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NAGPAQ9UK23 515 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO3Q9UK99 471 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GRXCR2A6NFK2 248 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZAR1LA6NP61 321 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HRKO00198 91 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BMP15O95972 392 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LMNAP02545 664 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1SP09871 688 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STRIP1Q5VSL9 837 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPNTQ6UXI9 565 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF207Q6ZRF8 634 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CYP2U1Q7Z449 544 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYLIPQ8WY64 445 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKS1AQ92625 1134 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZBTB9Q96C00 473 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ARXQ96QS3 562 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LPIN3Q9BQK8 851 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WACQ9BTA9 647 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGFLR1Q9H665 355 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COX11Q9Y6N1 276 aa-0.13□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXN1O15353 648 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPRY2O43597 315 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CGAP01215 116 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TATP17735 454 aaPredicted RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP4AP20648 1035 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CAMK2BQ13554 666 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC125Q86Z20 511 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ULK2Q8IYT8 1036 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNH6Q9H252 994 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C19orf73Q9NVV2 129 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF358Q9NW07 568 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SIRT5Q9NXA8 310 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRFN2Q9ULH4 789 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF536O15090 1300 aa-0.14□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERVH48-1M5A8F1 160 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEACAM5P06731 702 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF81P51508 661 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CENPCQ03188 943 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PDE3BQ13370 1112 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LCE3CQ5T5A8 94 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GFI1BQ5VTD9 330 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF585AQ6P3V2 769 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1orf127Q8N9H9 656 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RGMAQ96B86 450 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTPALQ9BTX7 342 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CARD14Q9BXL6 1004 aa-0.15□□□□□ -2.43
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPDYE5A6NIY4 337 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FFAR3O14843 346 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NOBOXO60393 691 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTTG1IPP53801 180 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNQ4P56696 695 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OLFML2BQ68BL8 750 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT77Q7Z794 578 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SEPT12Q8IYM1 358 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADAMTS15Q8TE58 950 aa-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP-0.16□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C6orf229H3BNL8 230 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ICAM4Q14773 271 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SURF1Q15526 300 aa-0.17□□□□□ -2.44
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MST1LQ2TV78 715 aa-0.17□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms