RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCRT1Q9BWW7 348 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MANSC1Q9H8J5 431 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UTS2RQ9UKP6 389 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAOK2Q9UL54 1235 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNHD1Q96M86 4753 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRWD3Q6RI45 1802 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VWFP04275 2813 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CACNA1GO43497 2377 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IFNL4K9M1U5 179 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 INSIG1O15503 277 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BRINP1O60477 761 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITGB3P05106 788 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT5P13647 590 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ITGA6P23229 1130 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 VEGFCP49767 419 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LGALS4P56470 323 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NDPQ00604 133 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTSQ03393 145 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 POLA2Q14181 598 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRIK4Q16099 956 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 IQCCQ4KMZ1 466 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF385BQ569K4 471 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C18orf65Q6ZTR6 163 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRRN4Q8WUT4 740 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM11Q96F44 468 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRX2Q99811 253 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CD93Q9NPY3 652 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRDM8Q9NQV8 689 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNH4Q9UQ05 1017 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CORINQ9Y5Q5 1042 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF292O60281 2723 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LAMB2P55268 1798 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF814B7Z6K7 855 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EREGO14944 169 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SLC34A2O95436 690 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ABCG1P45844 678 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CRISP1P54107 249 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TAP1Q03518 808 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COASYQ13057 564 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PLCL1Q15111 1095 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LEXMQ3ZCV2 418 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FERMT3Q86UX7 667 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADGRG3Q86Y34 549 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFX6Q8HWS3 928 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ACBD4Q8NC06 268 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NETO1Q8TDF5 533 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CTAGE1Q96RT6 745 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DIRC2Q96SL1 478 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRMOQ9BU70 441 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAM33Q9BZ11 813 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM30AQ9NZY2 134 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HPS5Q9UPZ3 1129 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TGP01266 2768 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HSPG2P98160 4391 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0U1RQF3 1178 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MUC21A0A140T8X8 626 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A1B0GU03 582 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C17orf102A2RUQ5 167 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM229AH3BQW9 127 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 J3QKU1 62 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFXAPO00287 272 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SYT5O00445 386 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SNAI2O43623 268 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CILPO75339 1184 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRNPP04156 253 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NUDT7P0C024 238 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RARBP10826 455 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBLN1P23142 703 aa-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms