RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PANK1Q8TE04 598 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SSH3Q8TE77 659 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TEPSINQ96N21 525 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MRIQ9BWK5 157 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RNF186Q9NXI6 227 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FOCADQ5VW36 1801 aa9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 UNCXA6NJT0 531 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC85CA6NKD9 419 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SREBF2Q12772 1141 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GORABQ5T7V8 394 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SPRYD7Q5W111 196 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FAM83AQ86UY5 434 aa9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ATP8B2P98198 1209 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 WNK4Q96J92 1243 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ABCF2Q9UG63 623 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RCAN3Q9UKA8 241 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK1Q14185 1865 aa9.44□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 BRCA2P51587 3418 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TM4SF4P48230 202 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TNNI3KQ59H18 835 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CEP85Q6P2H3 762 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PI16Q6UXB8 463 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA5Q8NB90 893 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 HOOK2Q96ED9 719 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GPR108Q9NPR9 543 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.43□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GAKO14976 1311 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RGS19P49795 217 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 NFIAQ12857 509 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 VGLL4Q14135 290 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SLF2Q8IX21 1173 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ELP3Q9H9T3 547 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CSADQ9Y600 493 aa9.42□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRFP10586 1907 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GJA5P36382 358 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MCAMP43121 646 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MECOMQ03112 1051 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TCP10Q12799 353 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DGKZQ13574 1117 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TTC39AQ5SRH9 613 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF15Q66K64 600 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FAM151AQ8WW52 585 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 OPTNQ96CV9 577 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 WRNIP1Q96S55 665 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 USP40Q9NVE5 1235 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 COG6Q9Y2V7 657 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MYH7P12883 1935 aa9.41□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 SIPA1L1O43166 1804 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 PHIPQ8WWQ0 1821 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D8O95759 1140 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH1A1P00352 501 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 BTDP43251 543 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 RGS3P49796 1198 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 INHBEP58166 350 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 GSTO1P78417 241 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K9P80192 1104 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 IFNL1Q8IU54 200 aa9.4□□□□□ -0.9
SGMS1-201ENST00000361543 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.4□□□□□ -0.9
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