RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 STRIP1Q5VSL9 837 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ECHDC1Q9NTX5 307 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF213O14771 459 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 GDF11O95390 407 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SNAPC2Q13487 334 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RHPN1Q8TCX5 695 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SLC4A9Q96Q91 983 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DBNDD2Q9BQY9 259 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KAT14Q9H8E8 782 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 BCL9O00512 1426 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 LMO7Q8WWI1 1683 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 XBP1P17861 261 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA5Q8NB90 893 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RNF208Q9H0X6 261 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KIF3AQ9Y496 699 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY9O60503 1353 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZBBXA8MT70 800 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM1O75626 825 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MBD4O95243 580 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 KIFC2Q96AC6 838 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D8O95759 1140 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TM4SF1P30408 202 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PHKA1P46020 1223 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC102BQ68D86 513 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SAMM50Q9Y512 469 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FAM196BA6NMK8 535 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 IGHDP01880 384 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CETPP11597 493 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD6Q6ZSS7 791 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ERO1AQ96HE7 468 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA3Q99758 1704 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 FKTNO75072 461 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 NTSR2O95665 410 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SLC1A4P43007 532 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PPM1EQ8WY54 764 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA5Q96FF9 252 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 H3BQV1 296 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 RGL2O15211 777 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PTGER2P43116 358 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SOX10P56693 466 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 IFFO2Q5TF58 517 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD14CQ5VZR4 134 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 AP5M1Q9H0R1 490 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ARMT1Q9H993 441 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 BRMS1Q9HCU9 246 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ALAS1P13196 640 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TSHZ3Q63HK5 1081 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 MOB2Q70IA6 237 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CPA4Q9UI42 421 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CACNA1GO43497 2377 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CA12O43570 354 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ASNSP08243 561 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZAP70P43403 619 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 SKAP1Q86WV1 359 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ISCA1Q9BUE6 129 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CLIP2Q9UDT6 1046 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 AOC2O75106 756 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 ATP8B2P98198 1209 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 CREBRFQ8IUR6 639 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM22Q8IYM9 498 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.21□□□□□ -1.57
PTPRC-201ENST00000348564 DPF2Q92785 391 aa5.21□□□□□ -1.57
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