RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 PHKG2P15735 406 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 GORABQ5T7V8 394 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 IQUBQ8NA54 791 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 MLKLQ8NB16 471 aa20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
KRCC1-201ENST00000347055 TUBBP07437 444 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 OAS2P29728 719 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SHC4Q6S5L8 630 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 APPBP2Q92624 585 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 DPF2Q92785 391 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 KIFC2Q96AC6 838 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MAP3K14Q99558 947 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 STK36Q9NRP7 1315 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ATRNO75882 1429 aa20.89■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 FANCGO15287 622 aa20.88■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MYH7P12883 1935 aa20.88■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TXLNAP40222 546 aa20.88■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 OSBP2Q969R2 916 aa20.88■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.88■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF18P17022 549 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 GNG11P61952 73 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 VPS37DQ86XT2 251 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 DCAF5Q96JK2 942 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1B0GUL7 405 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ANTXR2P58335 489 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SLC39A6Q13433 755 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CHST3Q7LGC8 479 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 GOLGA5Q8TBA6 731 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 PANX2Q96RD6 677 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ALG1Q9BT22 464 aa20.87■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MAP2K7O14733 419 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 USP5P45974 858 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 KANK3Q6NY19 840 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CEP112Q8N8E3 955 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CNNM3Q8NE01 707 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 FUT8Q9BYC5 575 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 FANCLQ9NW38 375 aa20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 NID2Q14112 1375 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF213O14771 459 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 FOXP2O15409 715 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SASH3O75995 380 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 FGAP02671 866 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TRDNQ13061 729 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TC2NQ8N9U0 490 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 INTS13Q9NVM9 706 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 A0A0G2JLW4 131 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 PNOCQ13519 176 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TRIM29Q14134 588 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 KRT40Q6A162 431 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 WASF1Q92558 559 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM87BQ96K49 555 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.85■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 RGPD5Q99666 1765 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CCDC175P0C221 793 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CAPN2P17655 700 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TIMM10P62072 90 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 RAB21Q9UL25 225 aa20.84■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 ERLIN1O75477 346 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SMARCE1Q969G3 411 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.83■□□□□ 0.93
KRCC1-201ENST00000347055 TMEM232C9JQI7 657 aa20.82■□□□□ 0.92
KRCC1-201ENST00000347055 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms