RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 STAP2Q9UGK3 403 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 CTSWP56202 376 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 ERBB4Q15303 1308 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-201ENST00000345716 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CCDC175P0C221 793 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PHKBQ93100 1093 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.356e-7■■□□□ 14
NISCH-201ENST00000345716 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 10.7
NISCH-201ENST00000345716 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.51■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 VEZTQ9HBM0 779 aa23.5■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 TMEM94Q12767 1356 aa23.5■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 GTF3C6Q969F1 213 aa23.5■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.5■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 HAUS7Q99871 368 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 KRT40Q6A162 431 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CLTCL1P53675 1640 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 BICDL2A1A5D9 508 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD62A6NC57 917 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 LETM2Q2VYF4 491 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 LRRC24Q50LG9 513 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 COPRSQ9NQ92 184 aa23.49■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 TUBB4AP04350 444 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 UBXN1Q04323 297 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 SPDYE4A6NLX3 237 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 TMEM63CQ9P1W3 806 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 GGA1Q9UJY5 639 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 GOPCQ9HD26 462 aa23.47■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CUTAO60888 179 aa23.47■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CCDC174Q6PII3 467 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CTAGE8P0CG41 777 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CBX8Q9HC52 389 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 PKP1Q13835 747 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 CCDC172P0C7W6 258 aa23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.45■■□□□ 1.35
NISCH-201ENST00000345716 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 BICD1Q96G01 975 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 DRC1Q96MC2 740 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 SPECC1Q5M775 1068 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF202O95125 648 aa23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 SHTN1A0MZ66 631 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R5BQ15173 497 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 V9GYY5 206 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TSPOAP1O95153 1857 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KRT13P13646 458 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D5Q92609 795 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KRT83P78385 493 aa23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 CCDC42Q96M95 316 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 PLCD1P51178 756 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 TTC38Q5R3I4 469 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 UNC13BO14795 1591 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-201ENST00000345716 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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