RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299543.8

CTDP1-202, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CTDP1, Length 3,380 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-202ENST00000299543 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 PFKFB1P16118 471 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 TRIM29Q14134 588 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 ATG3Q9NT62 314 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 ZNF446Q9NWS9 450 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.53■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 MRC1P22897 1456 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 TMEM67Q5HYA8 995 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 ATL3Q6DD88 541 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.52■□□□□ 0.08
CTDP1-202ENST00000299543 SYKP43405 635 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 VPS37DQ86XT2 251 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SMTNL1A8MU46 457 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 KRT40Q6A162 431 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.52■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CDC27P30260 824 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 TPM4P67936 248 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CCDC102BQ68D86 513 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NLRP10Q86W26 655 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NAPBQ9H115 298 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.51■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ZBTB43O43298 467 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SERPINC1P01008 464 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ADD2P35612 726 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ATP1A3P13637 1013 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SARM1Q6SZW1 724 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 HOMER1Q86YM7 354 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ARMT1Q9H993 441 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 YEATS4O95619 227 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PDE6AP16499 860 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PNOCQ13519 176 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 BRAPQ7Z569 592 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.5■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CTSWP56202 376 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PDILTQ8N807 584 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MBD4O95243 580 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 APOA5Q6Q788 366 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 BTG4Q9NY30 223 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 A0A1W2PQ27 194 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 A0A1W2PQ64 194 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 A0A1W2PQD8 194 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CDC25BP30305 580 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 TDO2P48775 406 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CFAP100Q494V2 611 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NBPF3Q9H094 633 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SLAIN2Q9P270 581 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.49■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PRKAB2O43741 272 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 PDE8BO95263 885 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SLC20A2Q08357 652 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CSF1RP07333 972 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NEDD4P46934 1319 aa15.48■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 NEMFO60524 1076 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ST5P78524 1137 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CCZ1BP86790 482 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 ABCF2Q9UG63 623 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 CDKL5O76039 1030 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 SKIDA1Q1XH10 827 aa15.47■□□□□ 0.07
CTDP1-202ENST00000299543 GPATCH11Q8N954 259 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms