RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637052.1

SYNGAP1-219, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TSPO	P30536	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RCVRN	P35243	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAMT	Q14353	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LINC01587	Q99440	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ATG12	O94817	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CDS2	O95674	445 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	INS	P01308	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	CD3D	P04234	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ICAM4	Q14773	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NMS	Q5H8A3	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	COPZ2	Q9P299	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE7	O76087	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	M6PR	P20645	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A087WTM6	91 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052		A0A096LPF7	62 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	IFNA5	P01569	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TAS2R60	P59551	318 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	B2M	P61769	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RHOB	P62745	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FGL1	Q08830	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	NEDD8	Q15843	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	FAM219A	Q8IW50	185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SYNGAP1-219	ENST00000637052	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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