RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637003.1

ARID1B-222, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5 BASIC

Gene ARID1B, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-222	ENST00000637003	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	HELT	A6NFD8	242 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003		K7EQG2	157 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RLN2	P04090	185 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CXCL3	P19876	107 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SULT1A1	P50225	295 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	NHLH2	Q02577	135 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	FCN2	Q15485	313 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	MGST2	Q99735	147 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A22	Q9H936	323 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003		E5RGE8	158 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	AGPAT2	O15120	278 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC00869	P0C866	280 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	STX12	Q86Y82	276 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TENM3	Q9P273	2699 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF98	A6NK75	572 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	MPC2	O95563	127 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5G3	P0C626	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	RGS21	Q2M5E4	152 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	UHRF2	Q96PU4	802 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ARID1B-222	ENST00000637003	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	HYPM	O75409	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	S100A11	P31949	105 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	CAMLG	P49069	296 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SELENOT	P62341	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	BAX	Q07812	192 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	MIC13	Q5XKP0	118 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	PATE2	Q6UY27	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	MED28	Q9H204	178 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	NRN1	Q9NPD7	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	DEFB1	P60022	68 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	RAP2B	P61225	183 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	HBG1	P69891	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	HBG2	P69892	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	CLINT1	Q14677	625 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	MBD2	Q9UBB5	411 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003		H3BRN7	92 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	FGF7	P21781	194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	OXA1L	Q15070	435 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	ZNF546	Q86UE3	836 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	RSG1	Q9BU20	258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	ARV1	Q9H2C2	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	PLP1	P60201	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	ATP6V1F	Q16864	119 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	COX7A2P2	O60397	106 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	GALR1	P47211	349 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	APOC4	P55056	127 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	FGL1	Q08830	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	RAB31	Q13636	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003		Q5BKY6	102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	STH	Q8IWL8	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ARID1B-222	ENST00000637003	SOCS3	O14543	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms