RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634285.1

DMD-231, Transcript of dystrophin, human

Gene DMD, Length 671 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DMD-231	ENST00000634285	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ZNF773	Q6PK81	442 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PLET1	Q6UQ28	207 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285		Q6ZVH6	145 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CEND1	Q8N111	149 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	STX19	Q8N4C7	294 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ARL11	Q969Q4	196 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285		Q96MT0	163 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MGLL	Q99685	303 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PECR	Q9BY49	303 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285		E7EUB6	86 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	LINC01619	G3V211	115 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MPZL2	O60487	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	GABARAP	O95166	117 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TRBV12-3	P01733	135 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	APELA	P0DMC3	54 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	GADD45A	P24522	165 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	HTR1D	P28221	377 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TALDO1	P37837	337 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	VEGFC	P49767	419 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SYNJ2BP	P57105	145 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PITPNA	Q00169	270 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RAB31	Q13636	194 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PSG5	Q15238	335 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FCN2	Q15485	313 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TRAM1	Q15629	374 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	HMGN3	Q15651	99 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CCDC58	Q4VC31	144 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MORN2	Q502X0	79 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MALSU1	Q96EH3	234 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RNF185	Q96GF1	192 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	NABP2	Q9BQ15	211 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	METTL9	Q9H1A3	318 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PSG8	Q9UQ74	426 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		2.99	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	AIP	O00170	330 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MFNG	O00587	321 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MYL12B	O14950	172 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FABP7	O15540	132 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	PDCD6	O75340	191 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	ADAP1	O75689	374 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	INS	P01308	110 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	IGLV2-23	P01705	113 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RBP4	P02753	201 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	IGKV1-16	P04430	117 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CRYBA1	P05813	215 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MYL12A	P19105	171 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	DYNLT3	P51808	116 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	EBI3	Q14213	229 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	NEDD8	Q15843	81 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	SNCB	Q16143	134 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	CDNF	Q49AH0	187 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	IDNK	Q5T6J7	187 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285		Q8IYB0	196 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	LINC00311	Q8N616	119 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	LFNG	Q8NES3	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
DMD-231	ENST00000634285	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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