RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM213A2RRL7 107 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C2orf70A6NJV1 201 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SAP30O75446 220 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OR5G3P0C626 314 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 NPPCP23582 126 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V0CP27449 155 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 Q6ZRG5 221 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CITED4Q96RK1 184 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.48□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 DNHD1Q96M86 4753 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 K7EMT4 169 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 COX7A2P2O60397 106 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 HYPMO75409 117 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CSN3P07498 182 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 FOLR2P14207 255 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C4BPBP20851 252 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CBLN1P23435 193 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PLP1P60201 277 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 IL34Q6ZMJ4 242 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 ARV1Q9H2C2 271 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.47□□□□□ -1.37
SGMS1-211ENST00000626236 CRYBB3P26998 211 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 PRR31Q5SQ13 230 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 PATE2Q6UY27 113 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SLC51BQ86UW2 128 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 STOML3Q8TAV4 291 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 ST8SIA2Q92186 375 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 MARC2Q969Z3 335 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 UHRF2Q96PU4 802 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 PFDN5Q99471 154 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SMPXQ9UHP9 88 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PS18 150 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 CHEK1O14757 476 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 C8orf88P0DMB2 117 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SPP1P10451 314 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 IGLL1P15814 213 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 S100A7P31151 101 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 BMI1P35226 326 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 RAB2AP61019 212 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SERF2P84101 59 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 LEMD1Q68G75 181 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 S100A7AQ86SG5 101 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 BAP18Q8IXM2 172 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 VSIRQ9H7M9 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A22Q9H936 323 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 MLXQ9UH92 298 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF98A6NK75 572 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 H3BRN7 92 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 BUB3O43684 328 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 MBP02144 154 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 SEC11BP0C7V7 166 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 M6PRP20645 277 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.44□□□□□ -1.38
SGMS1-211ENST00000626236 FAM78BQ5VT40 261 aa6.44□□□□□ -1.38
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