RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610454.4

SENP3-209, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

TSL 3

Gene SENP3, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-209ENST00000610454 IL5P05113 134 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 ORM2P19652 201 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 BCAP31P51572 246 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 S100A10P60903 97 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 DLK1P80370 383 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 S100A7AQ86SG5 101 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 C2orf50Q96LR7 162 aa9.87□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 C7orf66A4D0T2 115 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 FNDC10F2Z333 226 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 ID1P41134 155 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 GALR1P47211 349 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 CAV2P51636 162 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 PAX9P55771 341 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SELENOTP62341 195 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 OR1B1Q8NGR6 318 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SLC25A22Q9H936 323 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.86□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 KNCNA6PVL3 124 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 K7EPK0 472 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 CCNKO75909 580 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SPP1P10451 314 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 RAP2BP61225 183 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 TEPPQ6URK8 271 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 RARRES2Q99969 163 aa9.85□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 A0A0J9YWU9 116 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 PRAF2O60831 178 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 LINC00869P0C866 280 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 MEOX2P50222 304 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 LINC00052Q96N35 136 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 GPR82Q96P67 336 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 GGACTQ9BVM4 153 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 DOK5Q9P104 306 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.84□□□□□ -0.83
SENP3-209ENST00000610454 AGRNO00468 2067 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ZNF98A6NK75 572 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 GOSR2O14653 212 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 HYPMO75409 117 aa9.83□□□□□ -0.84
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SENP3-209ENST00000610454 PSMB3P49720 205 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ZNF546Q86UE3 836 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 STX12Q86Y82 276 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 OR11H2Q8NH07 326 aa9.83□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RNF24Q9Y225 148 aa9.83□□□□□ -0.84
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SENP3-209ENST00000610454 DEDDO75618 318 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 IFITM3Q01628 133 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RAB31Q13636 194 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 C16orf92Q96LL3 132 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SLC25A32Q9H2D1 315 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 TENM2Q9NT68 2774 aa9.82□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ISLRO14498 428 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 CST7O76096 145 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RLN2P04090 185 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 HBG1P69891 147 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 HBG2P69892 147 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RAB32Q13637 225 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 PMS2P11Q13670 270 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ARL6Q9H0F7 186 aa9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 H3BRN7 92 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 AGPAT2O15120 278 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 HLA-DRB4P13762 266 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 PLP1P60201 277 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 FGL1Q08830 312 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 ARL16Q0P5N6 197 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RSG1Q9BU20 258 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SCRT1Q9BWW7 348 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 RPRMQ9NS64 109 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.8□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 H3BMM0 161 aa9.79□□□□□ -0.84
SENP3-209ENST00000610454 SSNA1O43805 119 aa9.79□□□□□ -0.84
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